O setor de Oncologia da Santa Casa de Rio Claro atende a pacientes do Sistema Único de Saúde em diversas patologias oncológicas, pautada na humanização e acolhimento ao paciente com câncer. Conta com uma equipe de oncologistas clínico e cirúrgico em mastologia, gastro, urologia, ginecologia, cabeça e pescoço, além de uma equipe multidisciplinar. Segundo reconhecimento e determinação do DRS X (Piracicaba), a Santa Casa de Rio Claro tem a expertise em  cabeça e pescoço, o que significa, que todos os casos nessa especialidade  constatados em pacientes de Rio Claro, Piracicaba, Limeira e Araras (RRAS14 – Rede Regional de Atenção à Saúde), são encaminhados para a Santa Casa de Rio Claro.